Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDF0261
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0261, 1597 aa
1>>>pF1KSDF0261 1597 - 1597 aa - 1597 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9213+/-0.00126; mu= -15.1323+/- 0.076
mean_var=508.0982+/-107.236, 0's: 0 Z-trim(114.5): 56 B-trim: 424 in 1/50
Lambda= 0.056898
statistics sampled from 15066 (15108) to 15066 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.464), width: 16
Scan time: 7.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597) 10810 903.4 0
CCDS34770.1 ARHGEF35 gene_id:445328|Hs108|chr7 ( 484) 3196 278.0 5.1e-74
CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 ( 802) 1684 154.1 1.7e-36
CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 618) 1222 116.1 3.7e-25
CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 710) 1222 116.1 4.1e-25
CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 ( 841) 951 93.9 2.4e-18
CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 ( 709) 916 91.0 1.5e-17
CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 791) 702 73.5 3.2e-12
CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 871) 702 73.5 3.4e-12
>>CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597 aa)
initn: 10810 init1: 10810 opt: 10810 Z-score: 4812.8 bits: 903.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10810; 99.9% identity (99.9% similar) in 1597 aa overlap (1-1597:1-1597)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QNSQQEGSRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QNSQQEESRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCQAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCPAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDF
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CCDS34 QLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD RRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD IFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD DHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGW
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KSD FPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
1570 1580 1590
>>CCDS34770.1 ARHGEF35 gene_id:445328|Hs108|chr7 (484 aa)
initn: 3196 init1: 3196 opt: 3196 Z-score: 1442.4 bits: 278.0 E(32554): 5.1e-74
Smith-Waterman score: 3196; 99.0% identity (99.6% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEAEEAQHGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RYYSPCEEHPAETNQNEGAESGTIRQGEELPSEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
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pF1KSD NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFPGASYLVTQIPGTQTESRAEELSPAALSPLLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QNSQQEGSRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
CCDS34 LSVL
>>CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 (802 aa)
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Smith-Waterman score: 1734; 41.4% identity (64.1% similar) in 839 aa overlap (782-1594:6-799)
760 770 780 790 800
pF1KSD TLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQASDPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRY--
::. . : : . : ..:: :. . .
CCDS17 MDCGPPATLQPH--LTGPPGTAHHPVAVCQQESLS
10 20 30
810 820 830 840 850 860
pF1KSD --NKPL--PPTP---DLPQPHLPP-ISAPGSS-RIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRG
. : ::.: :: : : . :::: . : : .. :: : . .
CCDS17 FAELPALKPPSPVCLDLF-PVAPEELRAPGSRWSLGTPAPLQGLL------WPLSPGG-S
40 50 60 70 80
870 880 890 900 910 920
pF1KSD RSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSKSEVS
.. : :: : .: . : : . : :: : : : .. . . :..::
CCDS17 DTEITSGGMRPS--RAGSWPHCPG-AQP-PALEG--PWSPRHTQPQRRASHGSEKKSAWR
90 100 110 120 130
930 940 950 960 970 980
pF1KSD PGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHPEAPAREPLRRTTPQQGASGP
... :: . .. : : . ...: .:.: : : .: . . ::
CCDS17 KMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEP---GQVVQEQALSTEEP----RVELSGST-RVSLEGP
140 150 160 170 180 190
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD GRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGL
: . . : ..:: .: : .:...:. . :.. . . .:.
CCDS17 ERRRFSAS---ELMTRLH-----------SSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGM
200 210 220 230
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD RRPSILPEGSSDSR-GPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGGFS---RRCSKLINSSQLL
. :. :. :: .:. .. :. . ...: .:. : :: :... .: .:
CCDS17 EARSVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPP--LGSRSTNERRQSRFLLNS-VL
240 250 260 270 280 290
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD YQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSS------PRQPRKALVSSESY-LQRLSMASS
:::::::. .:.. ::: : : :: . : :: : : :. :: . .:.
CCDS17 YQEYSDVASARELRRQQREE---EGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGST
300 310 320 330 340 350
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRAT
::::.:: ::.: :: ... .: ::::.:::::.:::::..::..:: :: :. :
CCDS17 FSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSEC
360 370 380 390 400 410
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVT
:. :..:::::.: .:...: ::.:::. .: ... :.::::::.: : ::::::::::
CCDS17 LGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVT
420 430 440 450 460 470
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK
::.:::::.: :. : : .: .:: .:::::: : ::::::::::::::.:..::::
CCDS17 NQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILK
480 490 500 510 520 530
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSR
:: :: .: :::: .::..:...:: .::::.::::::.::.::.:: ::::::::.:
CCDS17 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQAR
540 550 560 570 580 590
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD WLVKSGELTALE-FSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSI
:::. :::. : . :.: . ::... :.:::::::::::: .: ..: :: :: .. .
CCDS17 WLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAEL
600 610 620 630 640 650
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD RGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISAL--AMPREELDL
. . .::.: ..: : : .. : . .::.:..:.::: :::::: . :.:. ..
CCDS17 QVRDLSLKLQGIPGHVFLLQLLHG-QHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEV
660 670 680 690 700 710
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD L-ECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQ
. : . :::::.:.:: . :::.:::.:.. : .::::::::::.:::.:: :
CCDS17 ISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAY
720 730 740 750 760 770
1570 1580 1590
pF1KSD VEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:: ::. .: .::.: .:: .: .: :
CCDS17 VEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
780 790 800
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CCDS46 GNGATPEEWPALADSP-TTLTEALRMIHP---IPADSWR--NLIEQIGLLYQEYRDKSTL
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.::.. :: : ..: : :.: :.. : . : .. . :.
CCDS46 QEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSR
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pF1KSD -SLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRAT
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CCDS46 FNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKI
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD LSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVT
: .: . ::: . :: :: :: .::. .:.:: .:::.: .: : ::. ::.
CCDS46 LHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVS
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK
::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. : ..::::::::::::::::.:::::
CCDS46 NQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILK
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSR
:.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :::..: ...:.::. : :.::.::
CCDS46 RVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSR
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD WLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRP----VHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPF
::.:.::: . ..: : : :. ..: :::: :.. : :... ::: ::
CCDS46 WLLKQGELQQM---SGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPR
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pF1KSD SSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMPREEL
. .: : :.. .: :.: : : .:.. .: ..... .::: ::...:: :.
CCDS46 GLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTK
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pF1KSD ------DLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGER
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CCDS46 FVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQER
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pF1KSD GWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:::: ...: : ::..:.::::: ::
CCDS46 GWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
570 580 590 600 610
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pF1KSD KHKGWSRQGLRRPSI--------LPEGSSD-SRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGG
. :::. : .. . :.:: . : . :. :. .:. . . . .
CCDS25 LNIPWSRMPPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPI
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pF1KSD FSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQS--QQRLESLSETPG-PSSPRQPRKALVSSE
. .::.. :::::: : .::.. :: : ..: : :.: :.. :
CCDS25 PADSWRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEE
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD ----------SYLQRLSMASSG----SLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIV
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CCDS25 EEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVT
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pF1KSD SEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNI
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CCDS25 SEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENI
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pF1KSD FSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRL
.:::.: .: : ::. ::.::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. :
CCDS25 VISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGL
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pF1KSD SLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRR
..::::::::::::::::.::::::.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :
CCDS25 PFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSR
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pF1KSD TEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEF-SASPGLRRKLNTRPVHLHLFN
::..: ...:.::. : :.::.::::.:.::: . ..: :: : . ..: :::
CCDS25 TEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFN
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pF1KSD DCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLF
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CCDS25 DLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYML
530 540 550 560 570 580
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.. .::: ::...:: :. ::.: :::::.. : .. :::.:: ::.
CCDS25 KASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADI
590 600 610 620 630
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pF1KSD VMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQ
. . ....:::. : :: : :::::: ...: : ::..:.::::: ::
CCDS25 LNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQN
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pF1KSD A
CCDS25 KDRRKLGSRNRQ
700 710
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CCDS11 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPR-NS
10 20 30 40 50
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pF1KSD HSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS-DPAVARQHRPLPSTPDS-SHHAQATPRWRYNKPL
.. : :. . : . : : :...: ..::: : .: : .
CCDS11 NDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASP
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD PPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSG
:.: : : : ..: . :: :. . . : : : .:....:
CCDS11 EPAPRSPVPPPKPSGSPCT-----PLLPMAGVLAQNGSASAP----GTVRRL-AGRFEGG
120 130 140 150 160
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pF1KSD GHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLC
..... :: .: :. .:.. . :. . : :. . .: ... :
CCDS11 AEGRA----QDADAPEPGLQARAD----VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPC
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CCDS11 VCHTTRPGLELRWVPV----GGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRS
220 230 240 250 260
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pF1KSD PEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGS
. . : : : . . :... :: :. . :..:.. :.
CCDS11 TAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDP------PQPDLDL---LSEDGIQT------GD
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CCDS11 SPDEAP----QNTPPATVEGREEEGLEVL---KEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELW
320 330 340 350 360
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pF1KSD SQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESYLQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTH
. . : : . . ..: :: . ..::::.:.:. : .: ...
CCDS11 GVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPP-------------GPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSP
370 380 390 400 410
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pF1KSD EDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSA
.....:: ::...::::::::: . .: : :: .:: ::. ..:. ::: .: :. ::
CCDS11 QERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSE
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD TFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFRE
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CCDS11 RFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSA
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pF1KSD VLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQ
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CCDS11 ELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSK
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD LIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLR
.:. :. .: :..::::: :.:...: . : .::.: :: : .:::: : : :
CCDS11 IIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTEL------GCR
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pF1KSD RK---LNTRP----VHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHK
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CCDS11 RGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDP-SGPPT
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pF1KSD NLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALA----MPREELDLLECYNSPQVQCL
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CCDS11 --FRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCS
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pF1KSD RAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQN
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CCDS11 ESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRH
770 780 790 800 810
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pF1KSD LKEAHRVKTAKLQLVEQQA
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CCDS11 LRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPPP
820 830 840
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pF1KSD ESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHPEAPARE
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CCDS46 ELRLDAGGNPASGLPMVRGSPRVRDDAAFQPQVPAPPQPRPPGHEEPWPIVLSTESPAAL
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pF1KSD PL--RRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDS---SGQ
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CCDS46 KLGTQQLIPKSLAVA------SKAKTPARHQSFGAAVLSREAARRDPKLLPAPSFSLDDM
90 100 110 120 130
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CCDS46 DVDKDPGGMLRRNLRNQSYR-AAMKGLGKPGGQGDAIQLSPKLQALAEEPSQPHTRSPAK
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CCDS46 NKKTLGRKRGHKGSFKDDPQL-YQEIQERGLNTSQESDDDI--LDESSSPEGT-QKVDAT
200 210 220 230 240 250
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pF1KSD VSSESYLQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLN
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CCDS46 IVVKSY--RPAQVT----WSQLPEVVELGILDQLSTEERKRQEAMFEILTSEFSYQHSLS
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CCDS46 ILVEEFLQSKELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILE
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD NHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPF
.:: . :. : .:..::.::.:.:..::. :::.:...: :.: : . ::::::.
CCDS46 EHAEKHFHPYIAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPM
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD QRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQK
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CCDS46 QRVTRLPLLMDTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQ
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pF1KSD IEF-ECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPV-HLHLFNDCLLLSRPR
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CCDS46 LDFSKVKSLPLISASRWLLKRGELFLVEET---GLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVVTKKK
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pF1KSD EGSRFLVFDHAPFSSIRGEK---CEMKLHG--------PHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFL
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CCDS46 SEESYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHP--FQVTLLRNSEGRQEQLL
550 560 570 580 590
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CCDS46 LSSDSASDRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVL
600 610 620 630 640 650
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CCDS46 QQE-DGWLYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
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.. . .:::.:.. .:. :.:... : :. .. .: .. . :.
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..: ..: : .: . :. : : . . .:.: ::.....:.::: . .....::. : ::
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CCDS58 SERARWITALGHSSGKPPADRTCG
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CCDS46 GSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSPAALKVGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]