Result of FASTA (omim) for
pF1KSDF0380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0380, 772 aa
1>>>pF1KSDF0380 772 - 772 aa - 772 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6137+/-0.000386; mu= 0.9671+/- 0.025
mean_var=224.5798+/-44.586, 0's: 0 Z-trim(120.1): 61 B-trim: 168 in 1/59
Lambda= 0.085583
statistics sampled from 34761 (34828) to 34761 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 13.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003195 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid ( 772) 5024 633.6 9.3e-181
XP_005257467 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 772) 5024 633.6 9.3e-181
XP_005257468 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 761) 3852 488.9 3.4e-137
NP_001317190 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 761) 3852 488.9 3.4e-137
XP_005257469 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 742) 3257 415.4 4.3e-115
NP_001317191 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 742) 3257 415.4 4.3e-115
XP_005257472 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 731) 3251 414.7 7.1e-115
NP_006155 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid ( 605) 859 119.3 4.9e-26
NP_004280 (OMIM: 604135) nuclear factor erythroid ( 694) 846 117.7 1.7e-25
NP_001138884 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589) 838 116.7 2.9e-25
NP_001300829 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589) 838 116.7 2.9e-25
NP_001300830 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589) 838 116.7 2.9e-25
NP_001300833 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 505) 668 95.7 5.3e-19
NP_001300832 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 532) 668 95.7 5.5e-19
NP_001300831 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 575) 668 95.7 5.9e-19
NP_001138885 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 582) 668 95.7 5.9e-19
XP_005268963 (OMIM: 601490) PREDICTED: transcripti ( 373) 619 89.5 2.7e-17
NP_001129495 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373) 619 89.5 2.7e-17
NP_001248390 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373) 619 89.5 2.7e-17
NP_006154 (OMIM: 601490) transcription factor NF-E ( 373) 619 89.5 2.7e-17
NP_996749 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736) 326 53.5 3.7e-06
NP_001177 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736) 326 53.5 3.7e-06
XP_016866654 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 283 48.3 0.00016
XP_011534341 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 283 48.3 0.00016
XP_016866655 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 283 48.3 0.00016
NP_001164265 (OMIM: 605394) transcription regulato ( 841) 283 48.3 0.00016
XP_005248816 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 283 48.3 0.00016
NP_068585 (OMIM: 605394) transcription regulator p ( 841) 283 48.3 0.00016
XP_011534342 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841) 283 48.3 0.00016
XP_005248815 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 877) 283 48.3 0.00017
XP_016866648 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866652 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866653 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866647 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866651 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866650 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866649 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866645 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
XP_016866646 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927) 283 48.3 0.00018
>>NP_003195 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2-re (772 aa)
initn: 5024 init1: 5024 opt: 5024 Z-score: 3366.1 bits: 633.6 E(85289): 9.3e-181
Smith-Waterman score: 5024; 100.0% identity (100.0% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-772)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
730 740 750 760 770
>>XP_005257467 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor (772 aa)
initn: 5024 init1: 5024 opt: 5024 Z-score: 3366.1 bits: 633.6 E(85289): 9.3e-181
Smith-Waterman score: 5024; 100.0% identity (100.0% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-772)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
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pF1KSD RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
730 740 750 760 770
>>XP_005257468 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor (761 aa)
initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 2584.2 bits: 488.9 E(85289): 3.4e-137
Smith-Waterman score: 4914; 98.6% identity (98.6% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDL------
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 -----GAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770
pF1KSD VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
710 720 730 740 750 760
>>NP_001317190 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2 (761 aa)
initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 2584.2 bits: 488.9 E(85289): 3.4e-137
Smith-Waterman score: 4914; 98.6% identity (98.6% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-761)
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NP_001 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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>>XP_005257469 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor (742 aa)
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Smith-Waterman score: 4754; 96.1% identity (96.1% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-742)
10 20 30 40 50 60
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XP_005 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
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>>NP_001317191 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2 (742 aa)
initn: 3249 init1: 3249 opt: 3257 Z-score: 2187.3 bits: 415.4 E(85289): 4.3e-115
Smith-Waterman score: 4754; 96.1% identity (96.1% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR
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pF1KSD QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 Q------------------------------FPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
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pF1KSD LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQN
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pF1KSD VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPP
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pF1KSD QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS
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pF1KSD LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
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pF1KSD AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
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pF1KSD EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770
pF1KSD VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
700 710 720 730 740
>>XP_005257472 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor (731 aa)
initn: 4362 init1: 3249 opt: 3251 Z-score: 2183.4 bits: 414.7 E(85289): 7.1e-115
Smith-Waterman score: 4644; 94.7% identity (94.7% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-731)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRN
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDL------
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 -----GAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPA
180 190 200 210 220
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pF1KSD QVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 Q------------------------------FPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG
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pF1KSD AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQE
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
680 690 700 710 720 730
>>NP_006155 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid 2-re (605 aa)
initn: 943 init1: 582 opt: 859 Z-score: 588.4 bits: 119.3 E(85289): 4.9e-26
Smith-Waterman score: 1048; 35.9% identity (61.9% similar) in 632 aa overlap (161-754:7-597)
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGRE
:: : ...:.::::::::::::::..::
NP_006 MMDLELPP-PGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSRE
10 20 30
200 210 220 230 240
pF1KSD VFDYSHRQKEQDVEKELRDGGE-QDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT
:::.:.:.:: ..::. . : :. : .:. .: .: :::: .: : :. . :.
NP_006 VFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQ-PAQHIQS
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290
pF1KSD ------------------ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPP
:: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : :
NP_006 ETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESP
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330
pF1KSD AL--QNNLLSPLLTGTE-SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSA
.. :. :: . .. .: :: :: :..:.:: :.: ... : . : .
NP_006 VFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVP
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PPGDPLST--NYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFL-LFSPEVESLPVASSSTLLPL
: :. :: . . : :... .:.:: :: : :. . . . : .
NP_006 SPEAKLTEVDNYHFYSSIP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTV
220 230 240 250 260
400 410 420 430 440 450
pF1KSD APSNS-TSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDL
:: ...:. ::. .... :..... : : :. :.: . :.. ::
NP_006 NSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSM-----PS-PATLSHSLSELLNGPIDVSDL
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.. ..:: . . : :::::.::..: :: ..: : : ::: ...
NP_006 SLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT----------
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pF1KSD SSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-
.: : :::. .:. : :.: . . : : : .: : :..
NP_006 -------LLGLS-DSEVEELDSAPGSV--KQNGPKTPVHSSGDMVQ----PLSPSQGQST
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pF1KSD HTYNMAPSALDSADLPPPSALKKG--SKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIIN
:... .:: . .: .:.:... :. ...::: ::.:..::: .::::
NP_006 HVHDAQCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIIN
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD LPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRD
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NP_006 LPVVDFNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDE
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pF1KSD KARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIP
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NP_006 KEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVP
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pF1KSD RTMADQQARRQERKPKDRRK
..
NP_006 KSKKPDVKKN
600
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NP_004 LSPF----SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVH
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: ::.: :: . : :: : .
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..: . . . . .: .:.... . :. :. .: . : ..:.: :
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pF1KSD TFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQA
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NP_004 CTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPE
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pF1KSD SADLPPPSALKKGSKEKQADFL---DKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELL
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pF1KSD SKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVE
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NP_004 SRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQ
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pF1KSD FLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARR
... ::::...::...:.::::..::: .:..:::: . :::.:..:. .. . ..
NP_004 CNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKK
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pF1KSD QERKPKDRRK
. .: : .
NP_004 ETQKGKRK
690
>>NP_001138884 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid 2 (589 aa)
initn: 929 init1: 582 opt: 838 Z-score: 574.6 bits: 116.7 E(85289): 2.9e-25
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pF1KSD ESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREVFDYSHRQKEQ
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NP_001 MDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEY
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pF1KSD DVEKELRDGGE-QDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT-----------
..::. . : :. : .:. .: .: :::: .: : :. . :.
NP_001 ELEKQKKLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQ-PAQHIQSETSGSANYSQV
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pF1KSD -------ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPPAL--QNNLLSP
:: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : :.. :. ::
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NP_001 ETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDN
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NP_001 YHFYSSIP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNT
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NP_001 DFGDEFYSAFIAEPSISNS--------MPSPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQN
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pF1KSD QASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAV
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NP_001 HPESTAEFNDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT-----------------LL
320 330 340 350
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pF1KSD GYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-HTYNMAPSA
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NP_001 MSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKG
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NP_001 ENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKK
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pF1KSD RQERKPKDRRK
NP_001 N
772 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:00:05 2016 done: Thu Nov 3 09:00:07 2016
Total Scan time: 13.800 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]