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# NO CUT ENZYMES (  163 enzymes) #
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AatII       Acc65I      AccI        AccII       AccIII      
AciI        AclI        AcyI        AflII       AgeI        
AhdI        Alw44I      AlwNI       AocI        Aor51HI     
ApaI        ApaLI       AscI        AseI        AsnI        
Asp718I     AspEI       AspI        AvaI        AviII       
AvrII       BalI        BamHI       BanI        BbeI        
BbvCI       BcgI        BciVI       BclI        BcnI        
BfrI        BglI        BlnI        BlpI        Bpu1102I    
BsaHI       BsaWI       BseAI       BsgI        BsiEI       
BsiWI       BsmBI       BsoBI       Bsp1407I    BspDI       
BspEI       BsrBI       BsrFI       BsrGI       BssHII      
BssSI       Bst1107I    BstAPI      BstBI       BstEII      
BstPI       BstUI       BstXI       BstZ17I     Bsu36I      
Cac8I       CelII       CfoI        Cfr10I      ClaI        
CpoI        DraI        DraII       DraIII      DrdI        
EaeI        EagI        Eam1105I    EclXI       Eco47III    
Eco52I      Eco81I      EcoNI       EcoO109I    EcoO65I     
EcoRV       EcoT22I     FauI        FbaI        FseI        
FspI        HaeII       HapII       HgaI        HhaI        
Hin1I       HinP1I      HincII      HindII      HpaI        
HpaII       KasI        KpnI        KspI        MfeI        
MluI        MluNI       MroI        MscI        MspA1I      
MspI        MunI        MvnI        NaeI        NarI        
NciI        NgoMIV      NheI        NotI        NruI        
NsiI        NspV        PacI        PaeR7I      PflFI       
PflMI       PinAI       PmeI        PpuMI       PshAI       
PshBI       Psp1406I    PstI        PvuI        PvuII       
RsrII       SacII       SalI        SapI        SbfI        
ScaI        SfcI        SfiI        SfoI        SfuI        
SgrAI       SmaI        SnaBI       SpeI        SphI        
Sse8387I    SspBI       SspI        StuI        SwaI        
TaqI        Tth111I     TthHB8I     Van91I      XbaI        
XhoI        XmaCI       XmaI        


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# ONE CUT ENZYMES (   38 enzymes) #
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AspHI         711  GAGCTC               G[AT]GC[AT]^C
BanII         711  GAGCTC               G[GA]GC[CT]^C
BbrPI         490  CACGTG               CAC^GTG
BbvI          135  GCTGC                GCAGC(8/12)
BfaI          178  CTAG                 C^TAG
BglII        1790  AGATCT               A^GATCT
BmyI          711  GAGCTC               G[AGT]GC[ACT]^C
BsaAI         490  CACGTG               [CT]AC^GT[GA]
BsaBI         556  GATCTTCATC           GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
BsiHKAI       711  GAGCTC               G[AT]GC[AT]^C
BsmFI         454  GTCCC                GGGAC(10/14)
BsmI          981  GCATTC               GAATGC(1/-1)
Bsp1286I      711  GAGCTC               G[AGT]GC[ACT]^C
BspHI         876  TCATGA               T^CATGA
BspMI         194  ACCTGC               ACCTGC(4/8)
BssKI         401  CCAGG                ^CC[ACGT]GG
BstF5I         99  GGATG                GGATG(2/0)
BstNI         401  CCAGG                CC^[AT]GG
EcoRII        401  CCAGG                ^CC[AT]GG
Fnu4HI        135  GCTGC                GC^[ACGT]GC
FokI           99  GGATG                GGATG(9/13)
HaeIII       1467  GGCC                 GG^CC
HindIII       615  AAGCTT               A^AGCTT
ItaI          135  GCTGC                GC^[ACGT]GC
MaeI          178  CTAG                 C^TAG
MamI          556  GATCTTCATC           GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
MvaI          401  CCAGG                CC^[AT]GG
MwoI          129  GCTGGGGCTGC          GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
NdeI          658  CATATG               CA^TATG
PmaCI         490  CACGTG               CAC^GTG
PmlI          490  CACGTG               CAC^GTG
RcaI          876  TCATGA               T^CATGA
SacI          711  GAGCTC               GAGCT^C
ScrFI         401  CCAGG                CC^[ACGT]GG
SexAI         400  ACCAGGT              A^CC[AT]GGT
SmlI         1393  CTTGAG               C^T[CT][GA]AG
TseI          135  GCTGC                G^C[AT]GC
XcmI          346  CCACATGAAGAGTGG      CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]TGG


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# TWO CUT ENZYMES (   11 enzymes) #
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AflIII        595  ACATGT               A^C[GA][CT]GT
             1024  ACATGT              
BsaI         1425  GAGACC               GGTCTC(1/5)
              404  GGTCTC              
BsaJI         986  CCATGG               C^C[ACGT][ACGT]GG
             1070  CCATGG              
BspLU11I      595  ACATGT               A^CATGT
             1024  ACATGT              
DsaI          986  CCATGG               C^C[GA][CT]GG
             1070  CCATGG              
EcoRI         294  GAATTC               G^AATTC
             1801  GAATTC              
EcoT14I       986  CCATGG               C^C[AT][AT]GG
             1070  CCATGG              
MaeII         491  ACGT                 A^CGT
              765  ACGT                
NcoI          986  CCATGG               C^CATGG
             1070  CCATGG              
SfaNI         174  GATGC                GCATC(5/9)
             1149  GCATC               
StyI          986  CCATGG               C^C[AT][AT]GG
             1070  CCATGG              


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# 3 OR MORE CUT ENZYMES (   46 enzymes) #
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AcsI        AfaI        AluI        AlwI        ApoI        
Asp700I     AvaII       BbsI        BpmI        BpuAI       
BseRI       BsiYI       BslI        BsmAI       BsrDI       
BsrI        BstYI       Cfr13I      DdeI        DpnII       
EarI        HinfI       HphI        Ksp632I     MaeIII      
MboI        MboII       MflI        MnlI        MseI        
MslI        NdeII       NlaIII      NlaIV       NspI        
PleI        RsaI        Sau3AI      Sau96I      TfiI        
Tru9I       Tsp45I      Tsp509I     TspRI       XhoII       
XmnI